数あるネット証券のなかからの選択ですが、①手数料、②トレーディングツールが主な選択するポイントだと思います。（他にも情報量や携帯から取引できるかとかはあると思いますが・・・）
手数料は安いに越した事はないですが、売買の仕方や売買の代金によって選択する証券会社も少し変わってくると思います。

・ある程度どんな売買スタイルや売買代金にも対応している証券会社は「クリック証券」や「SBI証券」や「楽天証券」などです。
・毎日頻繁に売買するというのならば売買一回ごとの手数料が定額の証券会社の「かざか証券」や「アイディーオー証券」です。
・私はまだ初心者だから10万円以内の小額でやりたいという人は、一日10万円以内の売買金額なら手数料無料の「SBI証券」や「松井証券」などです。
・大金でトレードするぞという人は、売買一回ごとの手数料が定額がきまっている「かざか証券」や「アイディーオー証券」です。（かざかはたしか金額の制限があったと思いますが･･･）
トレーディングツールですが、初心者にもとっつきやすく人気があるのは「楽天証券」のマーケットスピードと「SBI証券」のHETです。（楽天のマーケットスピードは新規に利用申請した際の最初のの3カ月は無料ですし、その後も一度売買しただけで売買日から3ヶ月無料です。SBI証券のHETも所定の条件（2008年3月現在では月3回売買すれば次の月は無料）を満たせば無料です。）

ここであげただけでも4つの証券会社があり、迷われてしまった方もいると思いますが、別に一つに選択する必要はありません。
最近では口座開設はもちろん無料ですし、実際に取引するまではお金は発生しないわけですから。
むしろ既に株をしている人で一つの会社でしか口座を開いていないという人は少ないと思います。とりあえず３つの会社の口座を開設して実際に使ってその中から自分にあった証券会社を選べばいいわけです。
毎日の分析は「楽天証券」や「SBI証券」のツールを使い、売買は「かざか証券」でするという組み合わせでももちろん大丈夫です。

お勧めネット証券会社の比較、リンク集はこちらに用意してありますので参考にしてください。